某天，一個都市消滅了——　　獨行俠運輸員拓也，與唯一從消滅中生還的少女小雪。兩人靠着本以爲音信全無的小雪父親傳來的信息，而開始前往消滅都市。但，兩人面前出現了意想不到的阻礙。那是對於小雪而言，過於衝擊的現實——對倖存者的思念，暗中活躍的神祕組織，以及被隱藏起來的陰謀。拓也與小雪，原本素昧平生的兩人，隨着旅行逐漸加深關係，並逐漸逼近消滅都市的謎團。