來自宇宙中的Bratcher星的擁有黑暗能量的三人組到達了地球，將能量附身於蒸汽機車上從而獲得了擁有自我意識且可以變身的機械生命體，其爲了實現“將世界籠罩在一片黑暗之中”的目的，決定首先以日本地區爲中心展開他們的黑暗大作戰。爲了阻止這一邪惡野心，維護正義的火車俠們從Hikarian星遠道而來，於是圍繞着火車俠們與黑暗軍團之間的正邪之爭開始了。