曾經突然出現的不明身份的敵人。安諾恩。 “超進化鐵道開發機構”通稱“ERDA（ELDA）”，作爲對付手段，開發了新幹線變形的機器人“辛卡里昂”，爲威脅做好了準備。 “能保護什麼，可愛的人。…我...…」 中學二年級的大成泰世爲了尋找兩年前失蹤的姐姐的線索，轉入進開學園中等部。 就在這時，時隔10年，匿名出現了。偶然發現泰西作爲辛卡里昂駕駛員具有很高的適應性值，被迫做出戰鬥的決定。 匿名者的身份和目的是什麼…。鬥爭結束時看到的真相…。 少年們的決心和成長的故事，現在開始了。